南京河海科技有限公司（简称“河海科技”）是水资源高效利用与工程安全国家工程研究中心（简称“工程中心”）的经营实体，于2006年12月由河海大学和中国长江三峡集团共同组建。
河海科技/工程中心根据国家水利行业和产业发展的需求，聚焦水资源集约高效利用、洪旱灾害防治与风险调控、水工程智能低碳建设与智慧运行、水环境治理与生态修复四个研究方向，形成了水资源综合利用技术、水电工程建设安全保障技术、水生态修复与保护技术、水文预报与库群调度技术等20个技术集群，总体水平达到国内领先、国际先进。
公司采取现代企业管理模式，组织技术产品的开发与集成、成果提炼与技术转移，主营业务包括：资源利用、环境保护、能源开发、水利水电、信息技术、工程安全等相关领域的产品研发与成果转化，以及相关工程的技术咨询、技术服务及人才培训、科技咨询等。
公司拥有高新技术企业、水文水资源调查评价（乙级）等资质，通过ISO9001质量管理体系认证、ISO14001环境管理体系认证、ISO45001职业健康安全管理体系认证，拥有百余项知识产权，获得2023年度中国产学研合作创新与促进奖，参与了《流域水生态完整性评价技术规范》等6项标准制订，干泥法清淤整装成套技术列入水利部先进实用技术重点推广目录。
公司与国电南京自动化股份有限公司上市公司合资参股设立南京河海南自水电自动化有限公司，从事水电自动化、岩土工程自动化、水资源与水利信息化等业务。
截至2024年底，河海科技资产总额9235.89万元，负债总额9715.24万元，国有资产保值增值率77.48%。